江苏省疾病预防控制中心(江苏省预防医学科学院)
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2023-10-10

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来源: 总务科

2023年度采购需求公告(第228批)

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  为便于供应商及时了解采购信息,现将江苏省疾病预防控制中心2023年度采购需求(第228批)予以公告,有意向者须提供公司资质、报价单(需加盖公章、注明联系人、联系方式)等资料发送至jscdczw@jscdc.cn邮件主题以“公司名称+项目名称+公告批次”命名,另外请按照参数要求逐条列出是否响应,报名截止时间:  2023年10月 16日 15 点 30 分,以邮件发送时间为准。联系人:秦老师,联系电话:025-83759427。

序号

服务名称

品牌

货号

规格

数量

预算(元)

1

全基因组测序分析服务

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/

28

56000

  本次公开的采购需求是本单位采购工作的初步安排,具体采购项目情况以相关采购公告和采购文件为准。


  技术参数:

  1. 实验室具有五年以上生物安全II级(BSL-2)资质和独立医学检验实验室资质,可以处理生物安全法规允许的相应病原体;

  2. 实验室搭载一代测序、二代测序和三代测序的技术平台,包括ABI3730xl、illumina NovaSeq、NextSeq、MiSeq等;测序读长最短不低于 150bp,平均测序读长为 200-300bp,不超过 350bp;数据准确度需 Q30(99.9%)>85%;碱基类型分布均匀,无 GC 分离;平均覆盖度 99.5% ;

  3. 病原体测序的报告周期约10个工作日,加急情况下极致周期7个工作日

  4. 配套自主研发的专用核酸提取试剂,简化核酸提取流程,提高细菌核酸提取效率,提高低浓度样本的文库构建和测序成功概率;

  5. 对病原体核酸抽提、病原体富集、文库构建、测序以及数据分析整个流程提供打包服务;

  6. 最终反馈的测序数据质量情况:能够进行PE150 及以上测序;原始数据量(碱基数)≥1.5G; Q20、Q30 高质量数据量(Clean data)≥1G

  7. 测序质量:基因组覆盖度≥99%,基因区覆盖度≥98%,整体覆盖深度≥100×;碱基数据质量值 Q30 比例≥85%,SCAFFOLD 数量<100 个,Contig 数量<200 个,单碱基错误率低于十万分之一。

  8. 细菌框架图项目最终提供的测序数据文件无需额外分析处理,可以直接上传国家致病菌识别网实验室监测信息的系统;

  9. 可有偿提供生物信息分析服务,如细菌的耐药基因预测、毒力基因预测、cgmlst、wgmlst、wgsnp等分析服务,可依据客户需求提供个性化分析服务;

  10. 可提供全基因组完整拼接数据,包含完整的 5’和 3’非编码区;具备优化好的流感、肠道和 SFTSV 病毒测序引物和扩增程序,适用于肠道相关病毒全基因扩增和测序;

  11. 可提供病毒核酸样本、原始样本、建库后样本等多种样本形式,核酸样本CT 值小于 25 的保证测序成功,若不成功仅收取样品质控费;收到标本后 3 个工作日内反馈核酸样本质评结果,2 个周内反馈测序拼接后序列数据、凝胶电泳图谱、生信分析报告;

  12. 普通一代测序及PCR产物测序均可提供核苷酸碱基序列和测序图谱;

  13. 拥有专业测序分析团队,相关人员有多年从事病原体测序工作经验;

  14. 针对测序不成功的检测样本,仅收取质检相关费用;

  15. 2021年服务超过的疾病预防控制中心单位超过40家

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