为便于供应商及时了解采购信息，现将江苏省疾病预防控制中心2025年度采购需求予以公告，有意向者须提供公司资质、报价单（需加盖公章、注明联系人、联系方式、单价、总价、货期等）等资料发送至：jscdczw@jscdc.cn，邮件主题以“公司名称+项目名称+公告批次”命名，报名截止时间:  2025年2月25日 15点 30 分，以邮件发送时间为准。联系人：秦老师，联系电话：025-83759427。

　　

　　项目参数如下：

　　1. 数据预处理

　　   - 原始数据质量控制：评估原始数据的质量。

　　   - 数据过滤：去除低质量 reads、接头序列和污染。

　　   - 数据修剪：修剪低质量碱基和接头序列。

　　2. 序列比对

　　   - 参考基因组比对：将 reads 比对到参考基因组。

　　   - 比对后处理：包括去重、局部重比对和碱基质量校正。

　　3. 变异检测

　　   - SNP/InDel 检测：识别单核苷酸变异和小片段插入缺失。

　　   - 结构变异检测：识别大片段插入、缺失、倒位和易位。

　　   - 拷贝数变异检测：识别拷贝数变异（CNV）。

　　4. 基因表达分析

　　   - 转录组比对：将RNA-seq reads比对到参考基因组。

　　   - 表达定量：使用featureCounts、HTSeq等工具进行基因表达定量。

　　   - 差异表达分析：使用DESeq2、edgeR等工具识别差异表达基因。

　　5. 功能注释

　　   - 变异注释：使用ANNOVAR、SnpEff等工具对变异进行功能注释。

　　   - 基因功能注释：使用GO、KEGG等数据库进行基因功能富集分析。

　　6. 高级分析

　　   - 突变特征分析：识别突变特征和模式。

　　    - 网络分析：构建基因或蛋白质互作网络。

　　7. 数据可视化

　　   - 变异可视化：使用IGV等工具展示变异位点。

　　   - 表达可视化：使用热图、火山图等展示差异表达基因。

　　8. 报告与交付

　　   - 分析报告：提供详细的分析结果、方法和结论。

　　   - 数据交付：提供原始数据、中间文件和最终结果文件。

　　9. 定制化服务

　　   - 个性化分析：根据客户需求定制分析流程。

　　   - 数据重分析：对已有数据进行重新分析或深度挖掘。

　　10. 技术支持与咨询

　　   - 技术支持：提供分析过程中的技术支持。

　　   - 咨询服务：提供数据解读和后续实验设计建议。