1990年第4届主题：使全国免疫接种率达到85％以上

　　1991年第5届主题：儿童的权利与机会——免疫、消灭脊髓灰质炎

　　1992年第6届主题：消灭脊髓灰质炎，开展乙型肝炎疫苗接种，保护儿童健康

　　1993年第7届主题：社会参与——消灭脊髓灰质炎

　　1994年第8届主题：1995年——全国消灭脊髓灰质炎

　　1995年第9届主题：无脊髓灰质炎世界

　　1996年第10届主题：普及儿童免疫，向孩子们献出一片爱心

　　1997年第11届主题：让每一个未免疫的儿童得到免疫

　　1998年第12届主题：免疫——孩子健康与家庭幸福

　　1999年第13届主题：乙肝——健康的大敌，疫苗——预防的武器

　　2000年第14届主题：免疫——关注流动人口中的儿童

　　2001年第15届主题：保持无脊髓灰质炎状态

　　2002年第16届主题：为了孩子健康注射乙肝疫苗

　　2003年第17届主题：乙肝疫苗－－献给新生命的爱

　　2004年第18届主题：免疫接种，预防乙肝

　　2005年第19届主题：实施免疫规划，保护儿童健康

　　2006年第20届主题：同样的权利，同样的健康—关注流动儿童预防接种

　　2007年第21届主题：让每个儿童都能按时接种疫苗是各级政府的责任

　　2008年第22届主题：预防接种，健康的保障

　　2009年第23届主题：及时接种疫苗，人人享有健康

　　2010年第24届主题：消除麻疹，控制乙肝，你我共参与

　　2011年第25届主题：接种疫苗，宝宝健康

　　2012年第26届主题：接种疫苗，家庭有责

　　2013年第27届主题：宝宝健康——从接种疫苗开始

　　2014年第28届主题：接种疫苗，保障健康

　　2015年第29届主题：预防接种——孩子的权利，社会的责任

　　2016年第30届主题：依法预防接种，享受健康生活

　　2017年第31届主题：规范接种疫苗，共健健康中国

　　2018年第32届主题：预防接种 守护生命

　　2019年第33届主题：防控传染病，接种疫苗最有效

　　2020年第34届主题：实施免疫规划，保护儿童健康

　　2021年第35届主题：接种疫苗 防控疾病 守卫健康 守护一生

　　2022年第36届主题：及时接种疫苗 保障生命健康

　　2023年第37届主题：主动接种疫苗，共享健康生活

　　2023年第38届主题：共同行动 接种疫苗 为全生命周期护航