受灾地区大面积遭受水淹，整个水体主要受到两个方面的污染；

　　（1）生物性污染；由于暴雨冲刷、洪水暴涨，水体受到大量人畜粪便、垃圾污物以及腐败变质的动植物等的污染，加之某些疾病患者的排泄物未经处理直接排入水体，导致水中各种致病微生物的大量增加和扩散。人们如果直接饮用或者用受污染的水漱口刷牙、洗涤瓜果，碗筷及凉拌生食蔬菜等，就可能受到病菌感染而导致疾病发生。洪水后容易发生和流行的传染病主要是伤寒、肝炎，痢疾，霍乱、钩端螺旋体病等。

　　（2）化学性污染：某些生产和经营销售农药，化学晶的车间、仓库等遭受水淹，产品或原料在抢运过程中可能不同程度地出现冲歆流失、包装损坏，存放凌乱或受到浸泡等情况，从而导致某些有毒有害物质污染水体。当这些物质达到一定含量时，会对人体造成直接或间接的危害，引起急性或慢性中毒。

　　此外，洪涝灾害还可能对集中式供水水源、供水系统、给水构筑物以及各种水井造成污染或损坏，从而影响饮用水的卫生质量。

　　洪涝灾区的饮用水问题，是灾区群众生活中最困难的问题，也是对群众健康威胁最大的问题。因此，灾区必须重视饮水卫生。