微生物实验室面积超500 M2，配备有飞行质谱微生物鉴定平台、全自动细菌鉴定及药敏分析系统、高通量实时荧光PCR仪、全自动酶联荧光免疫分析仪和两虫快速检测系统等先进的微生物检验设备，主要承担的检验项目覆盖食品及保健食品、化妆品、涉水产品和公共场所等健康相关产品的卫生微生物检验69项。